Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprgQ05909 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PtprgQ05909 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms