Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox9Q04887 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms