Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms