Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms