Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CkbQ04447 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CkbQ04447 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CkbQ04447 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CkbQ04447 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CkbQ04447 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CkbQ04447 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CkbQ04447 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CkbQ04447 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CkbQ04447 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms