Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kcnb1Q03717 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms