Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Scg2Q03517 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms