Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddr1Q03146 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms