Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mmp11Q02853 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms