Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GscQ02591 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GscQ02591 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GscQ02591 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GscQ02591 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GscQ02591 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GscQ02591 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GscQ02591 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GscQ02591 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GscQ02591 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GscQ02591 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GscQ02591 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GscQ02591 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GscQ02591 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GscQ02591 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GscQ02591 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GscQ02591 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GscQ02591 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GscQ02591 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GscQ02591 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GscQ02591 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GscQ02591 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GscQ02591 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GscQ02591 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GscQ02591 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GscQ02591 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GscQ02591 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GscQ02591 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GscQ02591 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GscQ02591 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GscQ02591 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GscQ02591 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GscQ02591 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GscQ02591 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GscQ02591 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GscQ02591 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GscQ02591 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GscQ02591 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GscQ02591 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GscQ02591 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GscQ02591 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GscQ02591 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GscQ02591 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GscQ02591 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GscQ02591 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GscQ02591 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GscQ02591 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GscQ02591 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GscQ02591 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GscQ02591 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GscQ02591 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GscQ02591 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GscQ02591 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GscQ02591 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GscQ02591 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GscQ02591 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GscQ02591 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GscQ02591 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GscQ02591 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GscQ02591 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GscQ02591 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GscQ02591 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GscQ02591 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GscQ02591 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GscQ02591 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GscQ02591 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GscQ02591 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GscQ02591 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GscQ02591 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GscQ02591 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GscQ02591 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GscQ02591 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GscQ02591 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GscQ02591 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GscQ02591 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GscQ02591 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GscQ02591 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GscQ02591 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GscQ02591 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GscQ02591 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GscQ02591 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GscQ02591 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GscQ02591 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GscQ02591 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GscQ02591 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GscQ02591 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GscQ02591 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GscQ02591 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GscQ02591 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GscQ02591 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GscQ02591 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GscQ02591 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GscQ02591 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GscQ02591 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GscQ02591 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GscQ02591 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GscQ02591 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GscQ02591 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GscQ02591 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GscQ02591 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms