Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlh1Q02576 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms