Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms