Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms