Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcqQ02111 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms