Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ascl1Q02067 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms