Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RykQ01887 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RykQ01887 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RykQ01887 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RykQ01887 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RykQ01887 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RykQ01887 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RykQ01887 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RykQ01887 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RykQ01887 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RykQ01887 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RykQ01887 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RykQ01887 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RykQ01887 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RykQ01887 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RykQ01887 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RykQ01887 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RykQ01887 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RykQ01887 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RykQ01887 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RykQ01887 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RykQ01887 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RykQ01887 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RykQ01887 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RykQ01887 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RykQ01887 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RykQ01887 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RykQ01887 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RykQ01887 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RykQ01887 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RykQ01887 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RykQ01887 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RykQ01887 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RykQ01887 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RykQ01887 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RykQ01887 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RykQ01887 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RykQ01887 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RykQ01887 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RykQ01887 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RykQ01887 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RykQ01887 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RykQ01887 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RykQ01887 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RykQ01887 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RykQ01887 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RykQ01887 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RykQ01887 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RykQ01887 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RykQ01887 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RykQ01887 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RykQ01887 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RykQ01887 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RykQ01887 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RykQ01887 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RykQ01887 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RykQ01887 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RykQ01887 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RykQ01887 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RykQ01887 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RykQ01887 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RykQ01887 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RykQ01887 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RykQ01887 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RykQ01887 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RykQ01887 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RykQ01887 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RykQ01887 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RykQ01887 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RykQ01887 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RykQ01887 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RykQ01887 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RykQ01887 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RykQ01887 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RykQ01887 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RykQ01887 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RykQ01887 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RykQ01887 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RykQ01887 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RykQ01887 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RykQ01887 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RykQ01887 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RykQ01887 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RykQ01887 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RykQ01887 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RykQ01887 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RykQ01887 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RykQ01887 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RykQ01887 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RykQ01887 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RykQ01887 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RykQ01887 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RykQ01887 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RykQ01887 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RykQ01887 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RykQ01887 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RykQ01887 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RykQ01887 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RykQ01887 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RykQ01887 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms