Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms