Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms