Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms