Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms