Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col8a1Q00780 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col8a1Q00780 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms