Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcf7Q00417 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms