Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx2Q00262 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx2Q00262 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx2Q00262 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx2Q00262 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx2Q00262 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx2Q00262 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx2Q00262 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx2Q00262 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stx2Q00262 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx2Q00262 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx2Q00262 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx2Q00262 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx2Q00262 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx2Q00262 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx2Q00262 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx2Q00262 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx2Q00262 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms