Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms