Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp9bP98195 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp9bP98195 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp9bP98195 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp9bP98195 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp9bP98195 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp9bP98195 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp9bP98195 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp9bP98195 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp9bP98195 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp9bP98195 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp9bP98195 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp9bP98195 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp9bP98195 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp9bP98195 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atp9bP98195 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp9bP98195 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp9bP98195 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp9bP98195 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp9bP98195 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp9bP98195 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp9bP98195 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp9bP98195 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atp9bP98195 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp9bP98195 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp9bP98195 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp9bP98195 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp9bP98195 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp9bP98195 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp9bP98195 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp9bP98195 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp9bP98195 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp9bP98195 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp9bP98195 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp9bP98195 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp9bP98195 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp9bP98195 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp9bP98195 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atp9bP98195 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp9bP98195 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp9bP98195 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp9bP98195 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp9bP98195 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp9bP98195 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp9bP98195 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp9bP98195 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp9bP98195 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp9bP98195 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp9bP98195 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp9bP98195 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp9bP98195 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp9bP98195 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp9bP98195 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp9bP98195 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp9bP98195 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp9bP98195 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms