Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VldlrP98156 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VldlrP98156 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VldlrP98156 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VldlrP98156 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VldlrP98156 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VldlrP98156 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VldlrP98156 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VldlrP98156 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VldlrP98156 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VldlrP98156 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VldlrP98156 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms