Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smyd1P97443 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smyd1P97443 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms