Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms