Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ElocP83940 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ElocP83940 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ElocP83940 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ElocP83940 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ElocP83940 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ElocP83940 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ElocP83940 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ElocP83940 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ElocP83940 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ElocP83940 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ElocP83940 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ElocP83940 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ElocP83940 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ElocP83940 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ElocP83940 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ElocP83940 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ElocP83940 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ElocP83940 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ElocP83940 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ElocP83940 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ElocP83940 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ElocP83940 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ElocP83940 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ElocP83940 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElocP83940 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElocP83940 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElocP83940 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElocP83940 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElocP83940 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElocP83940 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElocP83940 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElocP83940 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElocP83940 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElocP83940 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElocP83940 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElocP83940 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElocP83940 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElocP83940 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElocP83940 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElocP83940 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElocP83940 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElocP83940 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElocP83940 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElocP83940 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElocP83940 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElocP83940 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElocP83940 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ElocP83940 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ElocP83940 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ElocP83940 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ElocP83940 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ElocP83940 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ElocP83940 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ElocP83940 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ElocP83940 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ElocP83940 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ElocP83940 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ElocP83940 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ElocP83940 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ElocP83940 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ElocP83940 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElocP83940 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElocP83940 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElocP83940 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElocP83940 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElocP83940 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElocP83940 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ElocP83940 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElocP83940 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElocP83940 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElocP83940 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElocP83940 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElocP83940 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElocP83940 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElocP83940 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElocP83940 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElocP83940 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
ElocP83940 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
ElocP83940 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ElocP83940 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ElocP83940 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ElocP83940 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ElocP83940 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ElocP83940 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ElocP83940 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ElocP83940 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ElocP83940 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ElocP83940 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ElocP83940 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ElocP83940 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ElocP83940 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ElocP83940 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ElocP83940 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ElocP83940 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ElocP83940 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ElocP83940 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ElocP83940 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ElocP83940 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ElocP83940 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms