Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NyxP83503 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NyxP83503 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NyxP83503 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NyxP83503 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NyxP83503 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NyxP83503 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NyxP83503 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NyxP83503 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NyxP83503 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NyxP83503 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NyxP83503 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NyxP83503 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NyxP83503 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NyxP83503 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NyxP83503 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NyxP83503 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NyxP83503 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NyxP83503 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NyxP83503 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NyxP83503 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NyxP83503 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NyxP83503 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NyxP83503 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NyxP83503 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NyxP83503 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NyxP83503 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NyxP83503 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NyxP83503 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NyxP83503 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NyxP83503 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NyxP83503 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NyxP83503 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NyxP83503 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NyxP83503 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NyxP83503 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NyxP83503 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NyxP83503 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NyxP83503 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NyxP83503 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NyxP83503 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NyxP83503 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NyxP83503 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NyxP83503 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NyxP83503 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NyxP83503 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NyxP83503 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NyxP83503 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NyxP83503 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NyxP83503 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NyxP83503 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NyxP83503 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NyxP83503 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NyxP83503 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NyxP83503 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NyxP83503 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NyxP83503 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NyxP83503 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NyxP83503 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NyxP83503 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NyxP83503 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NyxP83503 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NyxP83503 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NyxP83503 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NyxP83503 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NyxP83503 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NyxP83503 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NyxP83503 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NyxP83503 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NyxP83503 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NyxP83503 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NyxP83503 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NyxP83503 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NyxP83503 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NyxP83503 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NyxP83503 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NyxP83503 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NyxP83503 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NyxP83503 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NyxP83503 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NyxP83503 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NyxP83503 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NyxP83503 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NyxP83503 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NyxP83503 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NyxP83503 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NyxP83503 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NyxP83503 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NyxP83503 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NyxP83503 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NyxP83503 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NyxP83503 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NyxP83503 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NyxP83503 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NyxP83503 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NyxP83503 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NyxP83503 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NyxP83503 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NyxP83503 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NyxP83503 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms