Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx1P81068 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx1P81068 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx1P81068 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx1P81068 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx1P81068 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx1P81068 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx1P81068 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx1P81068 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx1P81068 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx1P81068 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx1P81068 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx1P81068 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx1P81068 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Irx1P81068 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Irx1P81068 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx1P81068 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx1P81068 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx1P81068 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx1P81068 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx1P81068 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx1P81068 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx1P81068 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx1P81068 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx1P81068 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx1P81068 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx1P81068 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.9 ms