Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx3P81067 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx3P81067 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx3P81067 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx3P81067 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx3P81067 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 286 ms