Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx1P80205 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx1P80205 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx1P80205 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx1P80205 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx1P80205 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx1P80205 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx1P80205 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx1P80205 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx1P80205 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx1P80205 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx1P80205 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx1P80205 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms