Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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