Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms