Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms