Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms