Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfixP70257 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfixP70257 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfixP70257 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfixP70257 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfixP70257 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfixP70257 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfixP70257 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfixP70257 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfixP70257 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfixP70257 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NfixP70257 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfixP70257 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfixP70257 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfixP70257 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfixP70257 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfixP70257 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfixP70257 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfixP70257 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfixP70257 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfixP70257 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfixP70257 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfixP70257 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfixP70257 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfixP70257 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfixP70257 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfixP70257 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfixP70257 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfixP70257 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfixP70257 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfixP70257 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NfixP70257 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfixP70257 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfixP70257 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfixP70257 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfixP70257 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfixP70257 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfixP70257 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfixP70257 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfixP70257 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfixP70257 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfixP70257 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfixP70257 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfixP70257 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfixP70257 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NfixP70257 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NfixP70257 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NfixP70257 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NfixP70257 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfixP70257 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NfixP70257 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfixP70257 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfixP70257 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfixP70257 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfixP70257 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfixP70257 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfixP70257 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfixP70257 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfixP70257 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NfixP70257 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfixP70257 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfixP70257 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfixP70257 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfixP70257 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfixP70257 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfixP70257 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfixP70257 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfixP70257 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfixP70257 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NfixP70257 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfixP70257 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NfixP70257 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfixP70257 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfixP70257 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfixP70257 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfixP70257 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfixP70257 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfixP70257 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfixP70257 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfixP70257 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfixP70257 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfixP70257 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfixP70257 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfixP70257 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfixP70257 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfixP70257 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfixP70257 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NfixP70257 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfixP70257 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfixP70257 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfixP70257 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfixP70257 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfixP70257 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfixP70257 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfixP70257 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfixP70257 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfixP70257 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfixP70257 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfixP70257 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfixP70257 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms