Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf5P70191 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf5P70191 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf5P70191 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf5P70191 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Traf5P70191 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf5P70191 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms