Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crip1P63254 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crip1P63254 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crip1P63254 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crip1P63254 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crip1P63254 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Crip1P63254 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crip1P63254 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms