Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ElobP62869 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ElobP62869 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ElobP62869 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ElobP62869 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
ElobP62869 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ElobP62869 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ElobP62869 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ElobP62869 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ElobP62869 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ElobP62869 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ElobP62869 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ElobP62869 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ElobP62869 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ElobP62869 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ElobP62869 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ElobP62869 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ElobP62869 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ElobP62869 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ElobP62869 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ElobP62869 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ElobP62869 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ElobP62869 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ElobP62869 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ElobP62869 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ElobP62869 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ElobP62869 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ElobP62869 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ElobP62869 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ElobP62869 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ElobP62869 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ElobP62869 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ElobP62869 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ElobP62869 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ElobP62869 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ElobP62869 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ElobP62869 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ElobP62869 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ElobP62869 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ElobP62869 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ElobP62869 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ElobP62869 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ElobP62869 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ElobP62869 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ElobP62869 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ElobP62869 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ElobP62869 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ElobP62869 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ElobP62869 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ElobP62869 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ElobP62869 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ElobP62869 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ElobP62869 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ElobP62869 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ElobP62869 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ElobP62869 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ElobP62869 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ElobP62869 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ElobP62869 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ElobP62869 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ElobP62869 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ElobP62869 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ElobP62869 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ElobP62869 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ElobP62869 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ElobP62869 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ElobP62869 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ElobP62869 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ElobP62869 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ElobP62869 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ElobP62869 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ElobP62869 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ElobP62869 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ElobP62869 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ElobP62869 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ElobP62869 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ElobP62869 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ElobP62869 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ElobP62869 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ElobP62869 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ElobP62869 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ElobP62869 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ElobP62869 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ElobP62869 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ElobP62869 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ElobP62869 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ElobP62869 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ElobP62869 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ElobP62869 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ElobP62869 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ElobP62869 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ElobP62869 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ElobP62869 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ElobP62869 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ElobP62869 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ElobP62869 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ElobP62869 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ElobP62869 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ElobP62869 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ElobP62869 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms