Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vsnl1P62761 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vsnl1P62761 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vsnl1P62761 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vsnl1P62761 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vsnl1P62761 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vsnl1P62761 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vsnl1P62761 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vsnl1P62761 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vsnl1P62761 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vsnl1P62761 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vsnl1P62761 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vsnl1P62761 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vsnl1P62761 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vsnl1P62761 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vsnl1P62761 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vsnl1P62761 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vsnl1P62761 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vsnl1P62761 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vsnl1P62761 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms