Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpd1P62315 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms