Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm3P62311 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms