Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps11P62281 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps11P62281 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps11P62281 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps11P62281 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps11P62281 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps11P62281 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps11P62281 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps11P62281 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps11P62281 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps11P62281 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms