Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp46P62069 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp46P62069 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Usp46P62069 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Usp46P62069 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Usp46P62069 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Usp46P62069 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp46P62069 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Usp46P62069 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Usp46P62069 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Usp46P62069 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Usp46P62069 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Usp46P62069 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Usp46P62069 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp46P62069 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp46P62069 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp46P62069 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp46P62069 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp46P62069 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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