Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms