Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smg6P61406 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Smg6P61406 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Smg6P61406 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Smg6P61406 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Smg6P61406 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smg6P61406 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smg6P61406 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smg6P61406 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smg6P61406 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Smg6P61406 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smg6P61406 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms