Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf13P61216 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf13P61216 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf13P61216 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf13P61216 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf13P61216 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf13P61216 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf13P61216 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf13P61216 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms