Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actr1aP61164 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actr1aP61164 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms